接続したDAW等をスタートした時にopsixのステップ・シーケンサーも同時にスタートしない設定は可能ですか？

opsix本体で、GLOBAL > MIDI > Rx Transportパラメーターを表示してください。
このパラメーターは、MIDIのリアルタイム・メッセージのうち、スタート、ストップを受信するかどうかを設定します。

「Rx Transport = Off」に設定することで、DAW等をスタートした際に送信される、MIDIリアルタイム・スタート・メッセージの受信を禁止します。ステップ・シーケンサーがスタートしなくなります。